La Unidad Interna de Protección Civil (UIPC) es el órgano ejecutivo que tiene como función principal desarrollar, operar y dirigir el Programa Interno antes, durante y después de situaciones de riesgo, emergencia, siniestro o desastre. La UIPC estará integrada por miembros de la comunidad de la ENMH que representen a cada una de sus áreas que tengan la capacidad de decisión sobre las acciones a seguir en caso de la presencia de agentes o fenómenos perturbadores para hacer frente a posibles contingencias. También corresponde a la UIPC la capacitación, coordinación y supervisión de brigadistas, la orientación del personal, la organización y realización de simulacros, estudios, evaluación de los riesgos y de las medidas de mitigación, además de proponer la implantación de medidas de seguridad.